Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 OAC1YKL120W 975 nt7.02□□□□□ -1.29
HEF3P53978 HCR1YLR192C 798 nt7.02□□□□□ -1.29
HEF3P53978 RPL7BYPL198W 735 nt7.02□□□□□ -1.29
HEF3P53978 YDL034WYDL034W 345 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 MTC2YKL098W 1074 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 ATP1YBL099W 1638 nt7.01□□□□□ -1.29
HEF3P53978 HSX1tR(CCU)J 72 nt7□□□□□ -1.29
HEF3P53978 HSF1YGL073W 2502 nt7□□□□□ -1.29
HEF3P53978 NTE1YML059C 5040 nt6.99□□□□□ -1.29
HEF3P53978 EFM4YIL064W 774 nt6.99□□□□□ -1.29
HEF3P53978 DPH5YLR172C 903 nt6.99□□□□□ -1.29
HEF3P53978 KEX2YNL238W 2445 nt6.99□□□□□ -1.29
HEF3P53978 BUL1YMR275C 2931 nt6.99□□□□□ -1.29
HEF3P53978 SHE10YGL228W 1734 nt6.98□□□□□ -1.29
HEF3P53978 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.98□□□□□ -1.29
HEF3P53978 PRP2YNR011C 2631 nt6.97□□□□□ -1.29
HEF3P53978 RPS15YOL040C 429 nt6.97□□□□□ -1.29
HEF3P53978 ARG1YOL058W 1263 nt6.97□□□□□ -1.29
HEF3P53978 MRPL36YBR122C 534 nt6.96□□□□□ -1.3
HEF3P53978 CSC1YLR241W 2349 nt6.96□□□□□ -1.3
HEF3P53978 SNZ3YFL059W 897 nt6.95□□□□□ -1.3
HEF3P53978 CBP4YGR174C 513 nt6.95□□□□□ -1.3
HEF3P53978 COS9YKL219W 1224 nt6.95□□□□□ -1.3
HEF3P53978 PGA3YML125C 939 nt6.95□□□□□ -1.3
HEF3P53978 SNZ2YNL333W 897 nt6.95□□□□□ -1.3
HEF3P53978 YOL131WYOL131W 327 nt6.95□□□□□ -1.3
HEF3P53978 RHB1YCR027C 630 nt6.94□□□□□ -1.3
HEF3P53978 SFC1YJR095W 969 nt6.94□□□□□ -1.3
HEF3P53978 STL1YDR536W 1710 nt6.93□□□□□ -1.3
HEF3P53978 NOG2YNR053C 1461 nt6.93□□□□□ -1.3
HEF3P53978 RSC30YHR056C 2652 nt6.93□□□□□ -1.3
HEF3P53978 YLR194CYLR194C 765 nt6.93□□□□□ -1.3
HEF3P53978 DAL7YIR031C 1665 nt6.93□□□□□ -1.3
HEF3P53978 CLB2YPR119W 1476 nt6.92□□□□□ -1.3
HEF3P53978 COX26YDR119W-A 201 nt6.92□□□□□ -1.3
HEF3P53978 ENT2YLR206W 1842 nt6.92□□□□□ -1.3
HEF3P53978 NMD5YJR132W 3147 nt6.91□□□□□ -1.3
HEF3P53978 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt6.91□□□□□ -1.3
HEF3P53978 IDP1YDL066W 1287 nt6.91□□□□□ -1.3
HEF3P53978 CAD1YDR423C 1230 nt6.91□□□□□ -1.3
HEF3P53978 YNR048WYNR048W 1182 nt6.91□□□□□ -1.3
HEF3P53978 TRK2YKR050W 2670 nt6.91□□□□□ -1.3
HEF3P53978 SGE1YPR198W 1632 nt6.9□□□□□ -1.3
HEF3P53978 IPI1YHR085W 1005 nt6.9□□□□□ -1.3
HEF3P53978 HMS2YJR147W 1077 nt6.9□□□□□ -1.3
HEF3P53978 MRPL13YKR006C 795 nt6.9□□□□□ -1.3
HEF3P53978 ESC8YOL017W 2145 nt6.9□□□□□ -1.3
HEF3P53978 YAP1801YHR161C 1914 nt6.89□□□□□ -1.31
HEF3P53978 MTC5YDR128W 3447 nt6.89□□□□□ -1.31
HEF3P53978 PFA3YNL326C 1011 nt6.89□□□□□ -1.31
HEF3P53978 TEF1YPR080W 1377 nt6.89□□□□□ -1.31
HEF3P53978 TEF2YBR118W 1377 nt6.89□□□□□ -1.31
HEF3P53978 CHO1YER026C 831 nt6.88□□□□□ -1.31
HEF3P53978 YLL059CYLL059C 507 nt6.88□□□□□ -1.31
HEF3P53978 YLR317WYLR317W 435 nt6.88□□□□□ -1.31
HEF3P53978 PIN2YOR104W 849 nt6.88□□□□□ -1.31
HEF3P53978 NUD1YOR373W 2556 nt6.88□□□□□ -1.31
HEF3P53978 UGO1YDR470C 1509 nt6.87□□□□□ -1.31
HEF3P53978 GIR2YDR152W 798 nt6.87□□□□□ -1.31
HEF3P53978 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.87□□□□□ -1.31
HEF3P53978 GPT2YKR067W 2232 nt6.86□□□□□ -1.31
HEF3P53978 COG1YGL223C 1254 nt6.86□□□□□ -1.31
HEF3P53978 YHR045WYHR045W 1683 nt6.86□□□□□ -1.31
HEF3P53978 BAP2YBR068C 1830 nt6.85□□□□□ -1.31
HEF3P53978 snR82snR82 268 nt6.85□□□□□ -1.31
HEF3P53978 YGR176WYGR176W 348 nt6.85□□□□□ -1.31
HEF3P53978 DAL82YNL314W 768 nt6.85□□□□□ -1.31
HEF3P53978 RPT1YKL145W 1404 nt6.84□□□□□ -1.31
HEF3P53978 ARP2YDL029W 1176 nt6.84□□□□□ -1.31
HEF3P53978 SSK1YLR006C 2139 nt6.84□□□□□ -1.31
HEF3P53978 UTP7YER082C 1665 nt6.84□□□□□ -1.32
HEF3P53978 RRT2YBR246W 1164 nt6.83□□□□□ -1.32
HEF3P53978 ASN2YGR124W 1719 nt6.83□□□□□ -1.32
HEF3P53978 RTT106YNL206C 1368 nt6.82□□□□□ -1.32
HEF3P53978 ACF2YLR144C 2340 nt6.82□□□□□ -1.32
HEF3P53978 HAL5YJL165C 2568 nt6.81□□□□□ -1.32
HEF3P53978 MTQ2YDR140W 666 nt6.81□□□□□ -1.32
HEF3P53978 PSH1YOL054W 1221 nt6.81□□□□□ -1.32
HEF3P53978 PIF1YML061C 2580 nt6.81□□□□□ -1.32
HEF3P53978 PTK2YJR059W 2457 nt6.81□□□□□ -1.32
HEF3P53978 FAF1YIL019W 1041 nt6.8□□□□□ -1.32
HEF3P53978 SYN8YAL014C 768 nt6.8□□□□□ -1.32
HEF3P53978 YJR115WYJR115W 510 nt6.8□□□□□ -1.32
HEF3P53978 MTQ1YNL063W 945 nt6.8□□□□□ -1.32
HEF3P53978 YPR195CYPR195C 330 nt6.8□□□□□ -1.32
HEF3P53978 PPR1YLR014C 2715 nt6.8□□□□□ -1.32
HEF3P53978 DED81YHR019C 1665 nt6.8□□□□□ -1.32
HEF3P53978 RMD9YGL107C 1941 nt6.8□□□□□ -1.32
HEF3P53978 AMA1YGR225W 1782 nt6.8□□□□□ -1.32
HEF3P53978 YIL055CYIL055C 1884 nt6.79□□□□□ -1.32
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