Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb9P28076 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms