Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P18528 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P18528 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P18528 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P18528 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P18528 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P18528 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P18528 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P18528 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P18528 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P18528 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P18528 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P18528 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P18528 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P18528 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P18528 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P18528 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P18528 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18528 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18528 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18528 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18528 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18528 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18528 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18528 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18528 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18528 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18528 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18528 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18528 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18528 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18528 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18528 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18528 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18528 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P18528 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
P18528 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18528 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18528 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18528 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P18528 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18528 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18528 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18528 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18528 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18528 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18528 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18528 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P18528 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18528 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18528 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18528 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18528 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18528 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P18528 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P18528 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18528 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18528 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18528 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18528 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18528 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18528 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18528 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18528 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18528 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18528 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18528 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P18528 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18528 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18528 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18528 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18528 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18528 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18528 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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