Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptbp1P17225 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptbp1P17225 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptbp1P17225 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.1 ms