Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtrP07309 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtrP07309 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtrP07309 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtrP07309 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtrP07309 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtrP07309 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtrP07309 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtrP07309 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TtrP07309 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TtrP07309 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtrP07309 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtrP07309 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtrP07309 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TtrP07309 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtrP07309 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtrP07309 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtrP07309 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtrP07309 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtrP07309 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtrP07309 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtrP07309 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtrP07309 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtrP07309 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtrP07309 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtrP07309 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtrP07309 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtrP07309 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TtrP07309 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TtrP07309 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtrP07309 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TtrP07309 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtrP07309 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtrP07309 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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TtrP07309 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TtrP07309 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtrP07309 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtrP07309 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtrP07309 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtrP07309 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtrP07309 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtrP07309 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtrP07309 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TtrP07309 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtrP07309 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtrP07309 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtrP07309 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtrP07309 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TtrP07309 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TtrP07309 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtrP07309 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtrP07309 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TtrP07309 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtrP07309 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtrP07309 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtrP07309 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms