Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06320 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06320 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06320 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06320 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P06320 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06320 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06320 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06320 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06320 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06320 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06320 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06320 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06320 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06320 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P06320 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06320 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06320 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06320 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06320 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06320 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06320 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06320 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06320 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06320 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06320 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06320 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06320 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06320 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06320 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06320 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06320 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06320 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06320 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06320 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06320 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06320 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06320 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06320 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P06320 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06320 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06320 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06320 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06320 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06320 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06320 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06320 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06320 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06320 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06320 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06320 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06320 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06320 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06320 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06320 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P06320 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06320 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06320 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P06320 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06320 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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