Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxO54751 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxO54751 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxO54751 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxO54751 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxO54751 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxO54751 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxO54751 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxO54751 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxO54751 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxO54751 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxO54751 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxO54751 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxO54751 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxO54751 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxO54751 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxO54751 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CrxO54751 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CrxO54751 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CrxO54751 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CrxO54751 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CrxO54751 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CrxO54751 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CrxO54751 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CrxO54751 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CrxO54751 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CrxO54751 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CrxO54751 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CrxO54751 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CrxO54751 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CrxO54751 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CrxO54751 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CrxO54751 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CrxO54751 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CrxO54751 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CrxO54751 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CrxO54751 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CrxO54751 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CrxO54751 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CrxO54751 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CrxO54751 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CrxO54751 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CrxO54751 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CrxO54751 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CrxO54751 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CrxO54751 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CrxO54751 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CrxO54751 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CrxO54751 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CrxO54751 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CrxO54751 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CrxO54751 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CrxO54751 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CrxO54751 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CrxO54751 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CrxO54751 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CrxO54751 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CrxO54751 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CrxO54751 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CrxO54751 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CrxO54751 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CrxO54751 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CrxO54751 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrxO54751 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrxO54751 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrxO54751 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrxO54751 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrxO54751 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrxO54751 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrxO54751 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrxO54751 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrxO54751 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CrxO54751 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrxO54751 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrxO54751 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CrxO54751 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrxO54751 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrxO54751 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrxO54751 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrxO54751 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrxO54751 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrxO54751 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrxO54751 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CrxO54751 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrxO54751 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CrxO54751 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrxO54751 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrxO54751 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxO54751 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxO54751 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxO54751 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxO54751 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxO54751 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxO54751 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxO54751 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxO54751 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxO54751 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxO54751 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxO54751 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxO54751 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.2 ms