Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cavin1O54724 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cavin1O54724 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms