Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20828J3KMI7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20828J3KMI7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20828J3KMI7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms