Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf4bG5E8Z2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Taf4bG5E8Z2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf4bG5E8Z2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms