Protein–RNA interactions for Protein: D3YWE3

Vmn2r84, MCG21564, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r84D3YWE3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r84D3YWE3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r84D3YWE3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r84D3YWE3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r84D3YWE3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms