Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700006A11RikB9EHI3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700006A11RikB9EHI3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700006A11RikB9EHI3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms