Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap58B2RW38 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms