Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hbb-bh2B2RVB7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hbb-bh2B2RVB7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms