Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Usp42B2RQC2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp42B2RQC2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms