Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtcflA2APF3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtcflA2APF3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtcflA2APF3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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