Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal2aA2A9G7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms