Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited4Q9WUL8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cited4Q9WUL8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms