Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opn3Q9WUK7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms