Protein–RNA interactions for Protein: Q9R2B6

St6galnac4, Alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1,3-N-acetyl-galactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St6galnac4Q9R2B6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
St6galnac4Q9R2B6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
St6galnac4Q9R2B6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
St6galnac4Q9R2B6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms