Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Chrna6Q9R0W9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrna6Q9R0W9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna6Q9R0W9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.3 ms