Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vav3Q9R0C8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vav3Q9R0C8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vav3Q9R0C8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vav3Q9R0C8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vav3Q9R0C8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vav3Q9R0C8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vav3Q9R0C8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vav3Q9R0C8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vav3Q9R0C8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vav3Q9R0C8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vav3Q9R0C8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vav3Q9R0C8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vav3Q9R0C8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vav3Q9R0C8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vav3Q9R0C8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vav3Q9R0C8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vav3Q9R0C8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vav3Q9R0C8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vav3Q9R0C8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vav3Q9R0C8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vav3Q9R0C8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vav3Q9R0C8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms