Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx4Q9QY61 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx4Q9QY61 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx4Q9QY61 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms