Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nufip1Q9QXX8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nufip1Q9QXX8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms