Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copg2Q9QXK3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg2Q9QXK3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms