Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rai2Q9QVY8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rai2Q9QVY8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rai2Q9QVY8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rai2Q9QVY8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rai2Q9QVY8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rai2Q9QVY8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rai2Q9QVY8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rai2Q9QVY8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms