Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME2

Chst11, Carbohydrate sulfotransferase 11, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst11Q9JME2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chst11Q9JME2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chst11Q9JME2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Chst11Q9JME2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chst11Q9JME2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chst11Q9JME2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms