Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnga3Q9JJZ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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