Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nek6Q9ES70 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nek6Q9ES70 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek6Q9ES70 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms