Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Rnf138rt1Q9D9M9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Rnf138rt1Q9D9M9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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Rnf138rt1Q9D9M9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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Rnf138rt1Q9D9M9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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Rnf138rt1Q9D9M9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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Rnf138rt1Q9D9M9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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Rnf138rt1Q9D9M9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Rnf138rt1Q9D9M9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Rnf138rt1Q9D9M9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Rnf138rt1Q9D9M9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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Rnf138rt1Q9D9M9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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