Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8L0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8L0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8L0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8L0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8L0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms