Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsig1Q9D2J4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms