Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl34Q9D1R9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl34Q9D1R9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl34Q9D1R9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms