Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TbcbQ9D1E6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TbcbQ9D1E6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TbcbQ9D1E6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms