Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znhit3Q9CQK1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znhit3Q9CQK1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Znhit3Q9CQK1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Znhit3Q9CQK1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znhit3Q9CQK1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms