Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gdpd3Q99LY2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdpd3Q99LY2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms