Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrif1Q923B3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrif1Q923B3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.4 ms