Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spdl1Q923A2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spdl1Q923A2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms