Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek8Q91ZR4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek8Q91ZR4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms