Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep57l1Q8VDS7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep57l1Q8VDS7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms