Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Mterf1aQ8CHZ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mterf1aQ8CHZ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1aQ8CHZ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1aQ8CHZ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1aQ8CHZ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mterf1aQ8CHZ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mterf1aQ8CHZ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms