Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lrrc9Q8CDN9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lrrc9Q8CDN9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lrrc9Q8CDN9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lrrc9Q8CDN9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lrrc9Q8CDN9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lrrc9Q8CDN9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lrrc9Q8CDN9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrrc9Q8CDN9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrrc9Q8CDN9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Lrrc9Q8CDN9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms