Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
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Lrif1Q8CDD9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Lrif1Q8CDD9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Lrif1Q8CDD9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrif1Q8CDD9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Lrif1Q8CDD9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Lrif1Q8CDD9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Lrif1Q8CDD9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Lrif1Q8CDD9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Lrif1Q8CDD9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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