Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3R1

Brat1, BRCA1-associated ATM activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brat1Q8C3R1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Brat1Q8C3R1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brat1Q8C3R1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brat1Q8C3R1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.4 ms