Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SugctQ7TNE1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms