Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pds5aQ6A026 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pds5aQ6A026 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pds5aQ6A026 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms