Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rapgefl1Q68EF8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgefl1Q68EF8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rapgefl1Q68EF8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgefl1Q68EF8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 369.1 ms