Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim24Q64127 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim24Q64127 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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