Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pan3Q640Q5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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