Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbm38Q62176 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbm38Q62176 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbm38Q62176 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbm38Q62176 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbm38Q62176 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbm38Q62176 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbm38Q62176 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbm38Q62176 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbm38Q62176 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbm38Q62176 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbm38Q62176 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbm38Q62176 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbm38Q62176 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms